Bonjour kehann.
Votre fils aura deux statuts et cotisera aux deux organismes en parallèle. Les remboursements seront pris en charge par l'un ou l'autre, à priori par la mutuelle étudiante.
Il n'y a pas de soucis.
Peut-être vous êtes-vous déjà renseigné, mais la cotisation étudiante n'est pas forcément obligatoire ou payante, suivant votre profession et l'âge de votre fils, cf.
http://www.ameli.fr/assures/droits-et-d ... ociale.php